肥胖人群中，只有5%左右是因为患有内分泌疾病或其他可能的特殊病因引起的，其他的95%都是单纯性肥胖。单纯性肥胖发生的最根本原因是能量的摄入超过能量的消耗，最终导致了体内脂肪的过多蓄积，逐渐形成超重乃至肥胖。
首先，单纯性肥胖具有遗传倾向，不过，遗传因素在肥胖的形成过程中，只发挥20-40%的作用，更多的是环境因素及生活方式等多种因素间相互作用的结果。
随着经济的发展和食物的丰富，人们在吃饱的基本需求满足之后，膳食模式发生了很大的变化，高蛋白质、高脂肪、高热量的食物摄入量增加，能量的总摄入大增；不吃早餐、晚上吃得过多、频繁选择高热量快餐食品、进餐速度快、在外就餐增多、喜欢零食等行为习惯，也是导致肥胖发生的重要因素。
并且，热量摄入过多的同时，体力活动却越来越少。首先，办公室、久坐式的工作岗位增加，职业性体力劳动减少。其次，电器自动化带给我们生活的巨大变化就是家务劳动的强度降低，家务劳动量随之减少。第三，人们的出行方式也发生了巨大的改变，走路、骑车的越来越少，开车的日益增多。
经济的发展、物质的丰富，使人们的生活水平发生了巨大的变化，但同时，也造成了人们采取的进食模式、出行方式和休闲方式等开始不利于身体健康，发展也引发了空气污染、噪声污染等环境污染问题，造成了不良生活方式的恶性循环。
总之，能量摄入超过能量消耗，是导致肥胖的最根本原因，但同时，个体的行为方式是受社会经济因素影响的，因此，肥胖是多因素作用引起的综合症。
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